ለምን የሳንገር ቅደም ተከተል እንጠቀማለን?

2024 ደራሲ ደራሲ: Stanley Ellington | [email protected]. ለመጨረሻ ጊዜ የተሻሻለው: 2023-12-16 00:12

ሳንገር ቅደም ተከተል አጠቃላይ የናሙናዎች ብዛት ዝቅተኛ በሚሆንበት ጊዜ ለተለዋዋጭ የማጣሪያ ጥናቶች ውጤታማ አቀራረብ ነው። የናሙና ቁጥሩ ከፍተኛ በሆነበት ለተለዋዋጭ የማጣሪያ ጥናቶች፣ amplicon ቅደም ተከተል ከኤንጂኤስ ጋር የበለጠ ቀልጣፋ እና ወጪ ቆጣቢ ነው።

በተመሳሳይ፣ የሳንገር ቅደም ተከተል ዓላማ ምንድነው?

ሳንገር ቅደም ተከተል በብልቃጥ ዲ ኤን ኤ ማባዛት ወቅት ሰንሰለት የሚያቋርጥ ዲኦክሲኑክሊዮታይድ በዲ ኤን ኤ ፖሊሜሬዝ የመቀላቀል ሂደት ነው። የ SNV ዎችን ለመለየት በሰፊው ጥቅም ላይ የዋለው ዘዴ ነው.

እንዲሁም እወቅ፣ ለምን ddNTPs በ Sanger ቅደም ተከተል ጥቅም ላይ ይውላሉ? Dideoxynucleotides ሰንሰለት የሚያራዝሙ አጋቾች ናቸው። ዲ ኤን ኤ ፖሊሜሬዝ, ጥቅም ላይ ውሏል በውስጡ Sanger ዘዴ ለ የዲኤንኤ ቅደም ተከተል . ስለዚህ, እነዚህ ሞለኪውሎች የዲዲዮክሲክ ሰንሰለት-ማቋረጫ ዘዴን መሰረት ያደረጉ ናቸው የዲኤንኤ ቅደም ተከተል በፍሬድሪክ የተዘገበው Sanger እና የእሱ ቡድን በ 1977 እንደ ቀድሞው ሥራ ማራዘሚያ.

እንዲሁም NGS ከሳንገር ለምን ይሻላል?

Sanger ቅደም ተከተል መደርደር የሚችለው በአንድ ጊዜ አንድ ቁራጭ ብቻ ነው። ምክንያቱም NGS በሚሊዮኖች የሚቆጠሩ የዲ ኤን ኤ ቁርጥራጮችን ማሰር የሚችሉ የወራጅ ሴሎችን ይጠቀማል ፣ NGS እነዚህን ሁሉ ቅደም ተከተሎች በተመሳሳይ ጊዜ ማንበብ ይችላል. ይህ ከፍተኛ መጠን ያለው ዲ ኤን ኤ ሲይዝ በጣም ወጪ ቆጣቢ ያደርገዋል።

ለ Sanger ቅደም ተከተል ምን ያስፈልግዎታል?

ግብዓቶች ለ ሳንገር ቅደም ተከተል እነሱም የሚከተሉትን ያካትታሉ: A ዲ ኤን ኤ ፖሊሜሬዝ ኢንዛይም. ፕሪመር ፣ እሱም ነጠላ-ክር ያለው አጭር ቁራጭ ዲ ኤን ኤ ከአብነት ጋር የተያያዘ ዲ ኤን ኤ እና ለ polymerase እንደ "ጀማሪ" ይሠራል. አራቱ ዲ ኤን ኤ ኑክሊዮታይድ (dATP፣dTTP፣dCTP፣dGTP)